Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzrn3Q69ZS0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms