Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms