Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ptpn13Q64512 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ptpn13Q64512 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptpn13Q64512 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms