Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Taf6Q62311 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms