Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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