Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
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Rbm38Q62176 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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