Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sin3bQ62141 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms