Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lama3Q61789 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lama3Q61789 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Lama3Q61789 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Lama3Q61789 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Lama3Q61789 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Lama3Q61789 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lama3Q61789 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lama3Q61789 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lama3Q61789 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lama3Q61789 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lama3Q61789 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lama3Q61789 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Lama3Q61789 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Lama3Q61789 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Lama3Q61789 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama3Q61789 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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