Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamb3Q61087 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms