Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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