Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mkrn3Q60764 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms