Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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