Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Akap4Q60662 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms