Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a3Q5XF89 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms