Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms