Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bbs12Q5SUD9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bbs12Q5SUD9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bbs12Q5SUD9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bbs12Q5SUD9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bbs12Q5SUD9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bbs12Q5SUD9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bbs12Q5SUD9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Bbs12Q5SUD9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Bbs12Q5SUD9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Bbs12Q5SUD9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Bbs12Q5SUD9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Bbs12Q5SUD9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Bbs12Q5SUD9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bbs12Q5SUD9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211.1 ms