Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms