Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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