Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms