Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm5935Q497S0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5935Q497S0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5935Q497S0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5935Q497S0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5935Q497S0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5935Q497S0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm5935Q497S0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm5935Q497S0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5935Q497S0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm5935Q497S0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5935Q497S0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5935Q497S0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm5935Q497S0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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