Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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