Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms