Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Afg1lQ3V384 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms