Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2Q3V1H1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2Q3V1H1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms