Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc185Q3V118 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc185Q3V118 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms