Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Dnah12Q3V0Q1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dnah12Q3V0Q1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms