Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc43Q3V0L5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc43Q3V0L5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms