Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms