Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
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