Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc9Q3V038 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc9Q3V038 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc9Q3V038 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc9Q3V038 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc9Q3V038 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc9Q3V038 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc9Q3V038 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc9Q3V038 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc9Q3V038 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ttc9Q3V038 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9Q3V038 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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