Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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