Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc114Q3UX62 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms