Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Pfdn4Q3UWL8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Pfdn4Q3UWL8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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