Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Obox3Q3UT54 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms