Protein–RNA interactions for Protein: Q3US96

Gm10735, Predicted gene 10735, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10735Q3US96 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10735Q3US96 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms