Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf40Q3U319 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf40Q3U319 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf40Q3U319 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf40Q3U319 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf40Q3U319 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf40Q3U319 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf40Q3U319 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf40Q3U319 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf40Q3U319 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf40Q3U319 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf40Q3U319 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf40Q3U319 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf40Q3U319 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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