Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Palb2Q3U0P1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms