Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc9Q3U0M1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms