Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms