Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca4Q3TKT4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarca4Q3TKT4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms