Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2f1Q3THK3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2f1Q3THK3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms