Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccbe1Q3MI99 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccbe1Q3MI99 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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