Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
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Shroom4Q1W617 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
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Shroom4Q1W617 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
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Shroom4Q1W617 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Shroom4Q1W617 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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Shroom4Q1W617 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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Shroom4Q1W617 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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Shroom4Q1W617 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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Shroom4Q1W617 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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Shroom4Q1W617 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shroom4Q1W617 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
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Shroom4Q1W617 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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Shroom4Q1W617 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms