Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Samd11Q1RNF8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Samd11Q1RNF8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms