Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cpne9Q1RLL3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms