Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cers3Q1A3B0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms