Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptcd3Q14C51 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptcd3Q14C51 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptcd3Q14C51 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptcd3Q14C51 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptcd3Q14C51 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptcd3Q14C51 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptcd3Q14C51 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptcd3Q14C51 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptcd3Q14C51 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptcd3Q14C51 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms