Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms