Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms