Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAY3

Fam187b, Protein FAM187B, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam187bQ0VAY3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam187bQ0VAY3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms